Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX10Q9Y5X0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX10Q9Y5X0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX10Q9Y5X0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX10Q9Y5X0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX10Q9Y5X0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX10Q9Y5X0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX10Q9Y5X0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms