Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB12Q9Y5F1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB12Q9Y5F1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHB12Q9Y5F1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB12Q9Y5F1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB12Q9Y5F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms