Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
WASHC2CQ9Y4E1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
WASHC2CQ9Y4E1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
WASHC2CQ9Y4E1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
WASHC2CQ9Y4E1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
WASHC2CQ9Y4E1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
WASHC2CQ9Y4E1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
WASHC2CQ9Y4E1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
WASHC2CQ9Y4E1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
WASHC2CQ9Y4E1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms