Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXND1Q9Y4D7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXND1Q9Y4D7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PLXND1Q9Y4D7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXND1Q9Y4D7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXND1Q9Y4D7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms