Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMED5Q9Y3A6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMED5Q9Y3A6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMED5Q9Y3A6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms