Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSUH2Q9Y2M2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSUH2Q9Y2M2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSUH2Q9Y2M2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms