Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.06■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC61.05■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.03■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC61.03■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.03■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC61.01■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC61■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC61■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC61■■■■■ 7.36
NISCHQ9Y2I1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.99■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC60.99■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC60.99■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.97■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC60.97■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC60.97■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.96■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC60.96■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.96■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.96■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC60.95■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC60.94■■■■■ 7.35
NISCHQ9Y2I1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.93■■■■■ 7.34
NISCHQ9Y2I1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC60.93■■■■■ 7.34
NISCHQ9Y2I1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC60.92■■■■■ 7.34
NISCHQ9Y2I1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.92■■■■■ 7.34
NISCHQ9Y2I1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.89■■■■■ 7.34
NISCHQ9Y2I1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.87■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.87■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC60.87■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.87■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC60.84■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.84■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.84■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC60.84■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60.83■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC60.83■■■■■ 7.33
NISCHQ9Y2I1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC60.79■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.78■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC60.77■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC60.76■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC60.76■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.76■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC60.76■■■■■ 7.32
NISCHQ9Y2I1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC60.74■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC60.74■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC60.74■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.74■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC60.73■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC60.72■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC60.72■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC60.72■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.72■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.72■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC60.72■■■■■ 7.31
NISCHQ9Y2I1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.68■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC60.68■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC60.68■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC60.68■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC60.67■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.66■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC60.66■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.66■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC60.65■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC60.65■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC60.64■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC60.64■■■■■ 7.3
NISCHQ9Y2I1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.62■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.61■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.6■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC60.6■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC60.6■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.57■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC60.57■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC60.56■■■■■ 7.29
NISCHQ9Y2I1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.55■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.55■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC60.55■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC60.55■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC60.52■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.52■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC60.51■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC60.51■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.5■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.5■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60.5■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC60.5■■■■■ 7.28
NISCHQ9Y2I1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC60.48■■■■■ 7.27
NISCHQ9Y2I1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC60.47■■■■■ 7.27
NISCHQ9Y2I1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.47■■■■■ 7.27
NISCHQ9Y2I1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC60.43■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC60.42■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC60.42■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.42■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.41■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC60.41■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC60.4■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.4■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC60.4■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.4■■■■■ 7.26
NISCHQ9Y2I1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC60.4■■■■■ 7.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms