Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RNF6Q9Y252 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF6Q9Y252 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF6Q9Y252 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms