Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNFSF18Q9UNG2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFSF18Q9UNG2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFSF18Q9UNG2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms