Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRPF3Q9ULD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BRPF3Q9ULD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BRPF3Q9ULD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
BRPF3Q9ULD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BRPF3Q9ULD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF3Q9ULD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF3Q9ULD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
BRPF3Q9ULD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms