Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HCN2Q9UL51 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HCN2Q9UL51 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN2Q9UL51 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCN2Q9UL51 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HCN2Q9UL51 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms