Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIX4Q9UIU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SIX4Q9UIU6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SIX4Q9UIU6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIX4Q9UIU6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIX4Q9UIU6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIX4Q9UIU6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms