Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP13Q9UII6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP13Q9UII6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP13Q9UII6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP13Q9UII6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP13Q9UII6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP13Q9UII6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP13Q9UII6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP13Q9UII6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP13Q9UII6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms