Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN8Q9UBY8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN8Q9UBY8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN8Q9UBY8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms