Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL13Q9P2N7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL13Q9P2N7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL13Q9P2N7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL13Q9P2N7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms