Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MBD5Q9P267 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MBD5Q9P267 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
MBD5Q9P267 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
MBD5Q9P267 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MBD5Q9P267 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
MBD5Q9P267 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MBD5Q9P267 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms