Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCHIP1Q9P0W5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCHIP1Q9P0W5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCHIP1Q9P0W5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms