Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SACSQ9NZJ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SACSQ9NZJ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SACSQ9NZJ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms