Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDE1Q9NZC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
GDE1Q9NZC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GDE1Q9NZC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GDE1Q9NZC3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDE1Q9NZC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
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