Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TMOD3Q9NYL9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMOD3Q9NYL9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TMOD3Q9NYL9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMOD3Q9NYL9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMOD3Q9NYL9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TMOD3Q9NYL9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMOD3Q9NYL9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms