Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HOXC10Q9NYD6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC10Q9NYD6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXC10Q9NYD6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC10Q9NYD6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms