Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VNN3Q9NY84 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VNN3Q9NY84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VNN3Q9NY84 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VNN3Q9NY84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms