Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX18Q9NVP1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX18Q9NVP1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX18Q9NVP1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX18Q9NVP1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms