Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM140Q9NV12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM140Q9NV12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM140Q9NV12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM140Q9NV12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms