Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM106BQ9NUM4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM106BQ9NUM4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM106BQ9NUM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM106BQ9NUM4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.3 ms