Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CASS4Q9NQ75 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CASS4Q9NQ75 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASS4Q9NQ75 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CASS4Q9NQ75 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASS4Q9NQ75 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms