Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZCCHC17Q9NP64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZCCHC17Q9NP64 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ZCCHC17Q9NP64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms