Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC4Q9H6D8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FNDC4Q9H6D8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FNDC4Q9H6D8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNDC4Q9H6D8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNDC4Q9H6D8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FNDC4Q9H6D8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms