Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NSUN3Q9H649 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSUN3Q9H649 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSUN3Q9H649 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSUN3Q9H649 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms