Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEMA6BQ9H3T3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA6BQ9H3T3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA6BQ9H3T3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA6BQ9H3T3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms