Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS16Q9H269 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS16Q9H269 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VPS16Q9H269 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VPS16Q9H269 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VPS16Q9H269 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms