Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WWP1Q9H0M0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WWP1Q9H0M0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WWP1Q9H0M0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WWP1Q9H0M0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WWP1Q9H0M0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms