Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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