Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCSER1Q9C0I3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCSER1Q9C0I3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCSER1Q9C0I3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCSER1Q9C0I3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCSER1Q9C0I3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms