Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NLRP1Q9C000 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NLRP1Q9C000 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NLRP1Q9C000 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
NLRP1Q9C000 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NLRP1Q9C000 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP1Q9C000 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NLRP1Q9C000 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.9 ms