Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SALL3Q9BXA9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SALL3Q9BXA9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SALL3Q9BXA9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SALL3Q9BXA9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SALL3Q9BXA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SALL3Q9BXA9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms