Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF7Q9BWX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHF7Q9BWX1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF7Q9BWX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF7Q9BWX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms