Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3B5Q9BWJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF3B5Q9BWJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF3B5Q9BWJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SF3B5Q9BWJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms