Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIOK2Q9BVS4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIOK2Q9BVS4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK2Q9BVS4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK2Q9BVS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RIOK2Q9BVS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK2Q9BVS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIOK2Q9BVS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms