Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C9orf16Q9BUW7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C9orf16Q9BUW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf16Q9BUW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf16Q9BUW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms