Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RSRP1Q9BUV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSRP1Q9BUV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSRP1Q9BUV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms