Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NDFIP1Q9BT67 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDFIP1Q9BT67 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDFIP1Q9BT67 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms