Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LARP6Q9BRS8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LARP6Q9BRS8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
LARP6Q9BRS8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LARP6Q9BRS8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP6Q9BRS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP6Q9BRS8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms