Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM2D3Q9BRN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM2D3Q9BRN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TM2D3Q9BRN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms