Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GORASP1Q9BQQ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GORASP1Q9BQQ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GORASP1Q9BQQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms