Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMSS1Q9BQ75 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMSS1Q9BQ75 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMSS1Q9BQ75 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms