Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOPXQ9BPY8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOPXQ9BPY8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOPXQ9BPY8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOPXQ9BPY8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms