Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP2Q99959 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP2Q99959 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP2Q99959 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms