Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBGCP5Q96RT8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP5Q96RT8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms