Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TGS1Q96RS0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TGS1Q96RS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TGS1Q96RS0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TGS1Q96RS0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TGS1Q96RS0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms