Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GBP4Q96PP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GBP4Q96PP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GBP4Q96PP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GBP4Q96PP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GBP4Q96PP9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms